少女从地上爬起来后,根本就顾不上被摔破皮的胳膊,追在白人青年身后哭喊着追讨,相似的情况,楼顶上正在上演着四起,其他人很显然都已经见多了这样的事情,听着少女这样的哭喊,居然没有一个人上前帮上一把。2029年3月某日,某国大使馆遭到一群经大规模义体改造的武装分子的入侵,众多外国使节及其同侪眷属沦为人质,事态十万火急。草薙素子召集巴特、陀古萨等得力属下,并制定了周密的营救计划。谁知当一切都按部就班进行之时,意外突然发生。与此同时,距离大使馆不远的一座摩天大楼内,日本首相遭到密码箱炸弹的暗杀,素子之前的上司陆军501机关的机关长库露兹也在爆炸中丧生。经过缜密追查,素子等人发现一种能够篡改记忆的病䓯正在网络蔓延,而她的身世居然和一连串的事件有着密切联系。危机当前,阴谋悄然复出水面