讲述柯南在暂时恢复为工藤新一时，恰巧为帝丹高中校外旅行时期，一行人前往京都参访，在清水寺认识了女演员鞍知景子，新一被请托解读暗号，却在过程中遇上刹人事件，犯罪现场更留下疑似天狗袭击的痕迹。在一连串的骚动中，新一能否解开暗号，让真相拨云见日？当陈源背着苏云登上楼顶的时候，入目处，长三十多米，宽近二十米的楼顶上几乎挤满了人，有老有少，有男有女，陈源和苏云看过去的时候，这几百人正在像那栋七八层高的楼顶..